Yeni Şizofreni Çalışması, Protein-Protein Etkileşimlerine Odaklanıyor

İnsanlara benzer şekilde, bir gen hakkında, sahip olduğu şirkete ve nasıl davrandığına bakılarak çok şey öğrenilebilir. Pittsburgh Tıp Fakültesi'ndeki araştırmacılar, şizofreninin gelişimi hakkında daha fazla ipucu ortaya çıkarmak için şizofreni ile ilgili genler tarafından üretilen proteinlerin birbirleriyle nasıl etkileşime girdiğini araştırdılar.

Pitt Tıp Fakültesi biyomedikal bilişim bölümünde yardımcı doçent olan Ph.D. kıdemli araştırmacı Madhavi Ganapathiraju, "Proteinin sahip olduğu şirketi kontrol ederek ne yapabileceğini anlayabiliriz" dedi.

Örneğin, hokey oynayan birçok arkadaşın olduğunu biliyorsam, bu senin de hokeyle uğraştığın anlamına gelebilir. Benzer şekilde, bilinmeyen bir proteinin nöral sinyallemede yer alan birden fazla proteinle etkileşime girdiğini görürsek, örneğin bilinmeyen varlığın da aynı olaya dahil olma olasılığı yüksektir. "

Yakın tarihte, bilim adamları şizofreni için artan bir riske bağlı gen varyantlarını başarıyla tanımlayan birçok genom çapında ilişkilendirme çalışması (GWAS) yürüttüler. Ancak araştırmacılar, bu genlerin ürettiği proteinler, ne yaptıkları ve nasıl etkileşime girdikleri hakkında nispeten az şey bilindiğini söylüyor.

Ganapathiraju, "GWAS çalışmaları ve diğer araştırma çabaları bize şizofrenide hangi genlerin ilgili olabileceğini gösterdi" dedi. Yaptığımız şey bir sonraki adım. Bu genlerin birbirleriyle nasıl ilişkili olduğunu anlamaya çalışıyoruz, bu da bize hastalıkta önemli olan biyolojik yolları gösterebilir. "

Özetle, her gen protein üretir ve bu proteinler tipik olarak biyolojik bir süreçte birbirleriyle etkileşime girer. Bu proteinlerin birbirleriyle nasıl davrandığını incelemek, henüz çalışılmamış bir genin rolüne ışık tutabilir, şizofreni ile ilişkili yolları ve biyolojik süreçleri ve diğer karmaşık hastalıklarla ilişkisini ortaya çıkarabilir.

Araştırmacılar, Yüksek Hassasiyetli Protein Etkileşimi Tahmini (HiPPIP) adı verilen yeni bir hesaplama modeli geliştirip kullandıktan sonra, şizofreniye bağlı genlerle ilişkili 500'den fazla yeni protein-protein etkileşimi (ÜFE) keşfettiler.

Araştırmacılar, tarihsel olarak ve GWAS aracılığıyla tanımlanan şizofreni bağlantılı genlerin çok az örtüşmesine rağmen, modelin 100'den fazla ortak etkileşimi paylaştıklarını gösterdiğini ekliyorlar. Bulgular, bu akıl hastalığının biyolojik temellerinin daha iyi anlaşılmasına yol açabilir ve tedaviye giden yolu işaret edebilir.

Bulgular şu adreste çevrimiçi olarak yayınlandı: npj Şizofreni, Nature Publishing Group dergisi.

Kaynak: Pittsburgh Üniversitesi Sağlık Bilimleri Okulları